В МИС «Парус» реализована интеграция с «Интеллектуальной системой безопасности пациентов (ИСБП)», которая предназначена для поддержки принятия врачебных решений по профилактике, диагностике, лечению и анализу неблагоприятных событий, связанных с оказанием медицинской помощи.
В рамках национального проекта «Промышленная медицина» реализован механизм передачи данных в режиме реального времени между «Цифровым здравпунктом» и МИС «Парус», что позволяет своевременно получать данные о состоянии пациента для дальнейшего анализа.
Также в МИС «Парус» реализована интеграция с КАП «Гамма Мультивокс», в рамках которой появилась возможность просмотра и последующего анализа медицинских изображений. Комплексы аппаратно-программные (КАП) «Гамма Мультивокс» предназначены для автоматизации работы службы лучевой диагностики медицинских учреждений в целом и/или отдельных кабинетов и подразделений при профилактических и диагностических обследованиях, проведении углубленных научных исследований, планировании хирургических вмешательств и пр.